Během zhruba sta let "zlatých časů" plavebního kanálu bylo splaveno k řece Grosse Muehl téměř 8 milionů čtverečních metrů palivového dříví. Plavba do Vídně byla ukončena v roce 1892, kdy byla nahrazena levnější a rychlejší dopravou po železnici. Poslední plavba směrem do rakouského Haslachu se uskutečnila v roce 1916. Okolo roku 1900 byl plavební provoz v Čechách změněn z dopravy palivového dříví na dopravu dlouhého dříví. Doprava dříví po kanálu k Vltavě a dřevoskladu v Želnavě trvala až do roku 1961. Koncem 80. Let byla zahájena rekonstrukce tunelu. Podél Schwarzenberského plavebního kanálu vede téměř v celé délce doprovodná silnice sjízdná pro cyklisty.
